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【計算機輔助藥物設(shè)計】分子對接

時間:2022-01-07來源:趙云經(jīng)理

分子對接(molecular docking)是指利用“鎖鑰原理”搜索配體結(jié)合到受體上時最佳的結(jié)合構(gòu)象。分子對接可評價藥物等配體與受體的親和力大小,并分析他們的結(jié)合模式。是一種基于結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計方法,在酶學研究及藥物設(shè)計領(lǐng)域有著廣泛的應用。主要包括:小分子抑制活性、催化結(jié)合構(gòu)象、蛋白-蛋白相互作用等。

實驗項目:

1.小分子/多肽-蛋白  對接

主要用于蛋白酶抑制劑設(shè)計,包括:

1)抑制劑活性預測

2)蛋白-抑制劑相互作用機理解釋

3)抑制劑構(gòu)效關(guān)系分析

4)關(guān)鍵氨基酸分析


2.小分子/多肽-RNA/DNA  對接

主要用于核酸抑制劑設(shè)計,包括:

1)抑制劑活性預測、結(jié)合機理解釋

2)抑制劑構(gòu)效關(guān)系分析

3)關(guān)鍵堿基分析


3.蛋白-蛋白  對接

主要用于蛋白抑制劑、免疫共沉淀,包括

1)蛋白-蛋白相互作用分析

2)關(guān)鍵氨基酸分析


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