分子動力學模擬（molecular dynamics simulation）是一種基于物理、化學、數學等學科，模擬粒子體系的微觀運動的方法。在流體動力學、新材料、生物醫藥等方向應用較多。在藥物設計中可用于藥物與受體相互作用分析、結合能計算，抑制劑構效關系分析、受體氨基酸突變研究、大分子變構調節機制研究等等。常用分析：1.模型穩定性
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